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水稻細(xì)菌性谷枯病菌探針法qPCR試劑盒
產(chǎn)品及特點(diǎn)
水稻細(xì)菌性谷枯病菌(Burkholderia glumae)屬于細(xì)菌界，革蘭氏染色陰性菌，短桿狀，有莢膜，無芽孢，極生2～4根鞭毛，大小約1.5～2.5×0.5～0.7微米。帶菌種子是主要的初侵染源，浸種催芽時(shí)污染健康種子，在育苗期間感染發(fā)病。谷粒在萌發(fā)時(shí)受侵染，引起谷粒腐爛而無法出苗，芽谷受侵染則幼芽彎曲，病斑由水漬狀轉(zhuǎn)褐色，嚴(yán)重的腐爛枯死；水稻齊穗后乳熟期的綠色穗直立，染病谷粒初現(xiàn)蒼白色似缺水狀萎凋，漸變?yōu)榛野咨翜\黃褐色，內(nèi)外穎的先端或基部變成紫褐色，護(hù)穎也呈紫褐色。每個(gè)受害穗染病谷粒10～20粒左右，發(fā)病重的一半以上谷粒枯死，對(duì)水稻生產(chǎn)具有嚴(yán)重危害，對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成較大威脅，因此快速檢測(cè)水稻細(xì)菌性谷枯病菌具有重要的意義。為此，本公司以探針法qPCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)了水稻細(xì)菌性谷枯病菌的檢測(cè)試劑盒，它具有下列特點(diǎn)：
產(chǎn)品及特點(diǎn)
水稻細(xì)菌性谷枯病菌(Burkholderia glumae)屬于細(xì)菌界，革蘭氏染色陰性菌，短桿狀，有莢膜，無芽孢，極生2～4根鞭毛，大小約1.5～2.5×0.5～0.7微米。帶菌種子是主要的初侵染源，浸種催芽時(shí)污染健康種子，在育苗期間感染發(fā)病。谷粒在萌發(fā)時(shí)受侵染，引起谷粒腐爛而無法出苗，芽谷受侵染則幼芽彎曲，病斑由水漬狀轉(zhuǎn)褐色，嚴(yán)重的腐爛枯死；水稻齊穗后乳熟期的綠色穗直立，染病谷粒初現(xiàn)蒼白色似缺水狀萎凋，漸變?yōu)榛野咨翜\黃褐色，內(nèi)外穎的先端或基部變成紫褐色，護(hù)穎也呈紫褐色。每個(gè)受害穗染病谷粒10～20粒左右，發(fā)病重的一半以上谷粒枯死，對(duì)水稻生產(chǎn)具有嚴(yán)重危害，對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成較大威脅，因此快速檢測(cè)水稻細(xì)菌性谷枯病菌具有重要的意義。為此，本公司以探針法qPCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)了水稻細(xì)菌性谷枯病菌的檢測(cè)試劑盒，它具有下列特點(diǎn)：
1. 即開即用，用戶只需要提供樣品DNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化，分析靈敏度高，可以達(dá)到100拷貝/反應(yīng)。
3. 提供陽性對(duì)照，便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高，引物是根據(jù)水稻細(xì)菌性谷枯病菌DNA高度保守區(qū)設(shè)計(jì)，不會(huì)跟其他生物的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 既可用于定性檢測(cè)，又可用于定量檢測(cè)。定量檢測(cè)時(shí)線性范圍至少為5個(gè)數(shù)量級(jí)。
6. 本產(chǎn)品足夠50次20 μL體系的探針法qPCR反應(yīng)。
7. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
規(guī)格及成分
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成分 |
規(guī)格 |
包裝 |
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2×Probe qPCR MasterMix |
0.5mL |
0.5mL本色管 |
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熒光PCR專用模板稀釋液 |
1mL |
1.5mL綠蓋管 |
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超純水 |
1mL |
1.5mL藍(lán)蓋管 |
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水稻細(xì)菌性谷枯病菌qPCR陽性對(duì)照(1E7拷貝/μL) |
50次 |
0.5mL棕色管 |
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水稻細(xì)菌性谷枯病菌qPCR陽性對(duì)照(1E7拷貝/μL) |
50μL |
0.5mL黃蓋管 |
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使用手冊(cè) |
1份 |
無 |
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本產(chǎn)品采用五孔盒包裝 |
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注 意：引物-探針干粉在使用前需要短暫離心，然后在離心管中加入165uL的超純水充分混勻后再使用，未用完的需要-20℃保存。 |
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使用方法
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品以1E1-1E6拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照，只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對(duì)照。
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品以1E1-1E6拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照，只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對(duì)照。
1. 標(biāo)記6個(gè)離心管，分別為6、5、4、3、2、1。
2. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR專用模板稀釋液，用帶芯槍頭，下同）。
3. 在6號(hào)管中加入5 μL 1E7拷貝/μL 的陽性對(duì)照(試劑盒提供)，充分震蕩1分鐘，得1E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭，在5號(hào)管中加入5 μL 1E6拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得)，充分震蕩1分鐘，得1E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭，在4號(hào)管中加入5 μL 1E5拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得)，充分震蕩1分鐘，得1E4拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
樣品DNA的制備
7. 如果有N個(gè)樣品，設(shè)置N+2個(gè)提取，多出的一個(gè)是PC（樣品制備陽性對(duì)照），一個(gè)是NC（樣品制備陰性對(duì)照）?？梢杂?0 μL上步所得第4號(hào)稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次樣本制備所要求的起始樣本體積一樣，以此作為PC。另外用水作為NC。
8. 用自選方法純化樣品的DNA，本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)DNA提取試劑盒兼容，也可以選購本公司的免提取核酸釋放劑。
Probe qPCR反應(yīng)20 μL體系，在樣品制備室進(jìn)行
9. 如果做定量分析并且只做1次重復(fù)，則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管，其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品，1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照（用水做模板），6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析并且只做1次重復(fù)，則標(biāo)記N+4個(gè)PCR管，其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品，1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照（用水做模板），1個(gè)用于PCR陽性對(duì)照（直接用第6步第4號(hào)管的陽性對(duì)照稀釋液做模板）。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
數(shù)據(jù)處理
1. 如果樣本制備陽性對(duì)照或PCR陽性對(duì)照(包括標(biāo)曲樣本)結(jié)果為陰性，則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無效，不需要分析數(shù)據(jù)，需要重新樣本制備，重新進(jìn)行PCR擴(kuò)增或跟廠家聯(lián)系。如果樣本制備陰性對(duì)照或PCR陰性對(duì)照結(jié)果為陽性，說明環(huán)境污染，則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無效，不需要分析數(shù)據(jù)，需要跟廠家聯(lián)系。
2. 如果陰性對(duì)照和陽性對(duì)照均正常，則實(shí)驗(yàn)有效，可以進(jìn)入后續(xù)分析。
3. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè)，則以陽性對(duì)照濃度的log值為橫軸，以Ct值為縱軸，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值，再推算出其濃度。
4. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè)，只判斷陽性或陰性，則陰性對(duì)照Ct必須沒有讀數(shù)，或者大于或等于40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng)，有典型擴(kuò)增曲線，Ct值應(yīng)該小于40。對(duì)待測(cè)樣品，如果其Ct沒有讀數(shù)、大于或等于40則均為陰性，如果小于40則為陽性。
自備試劑
樣品DNA，超純水，核酸純化試劑盒
樣品DNA，超純水，核酸純化試劑盒
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸，-20℃保存，有效期1年
低溫運(yùn)輸，-20℃保存，有效期1年
